Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMARCB1Q12824 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMARCB1Q12824 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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