Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RBBP4Q09028 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms