Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYP4F3Q08477 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms