Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
LRP1Q07954 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms