Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CXCL9Q07325 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CXCL9Q07325 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms