Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COL16A1Q07092 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms