Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PAX8Q06710 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms