Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNEQ04844 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHRNEQ04844 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms