Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP7AQ04656 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP7AQ04656 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms