Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FAM92A-204ENST00000517718 827 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RD3L-201ENST00000557640 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 HYKK-205ENST00000566332 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CFTRP3-201ENST00000376400 212 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RN7SKP105-201ENST00000517192 314 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 BOLA3P1-201ENST00000530713 355 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AP000688.3-201ENST00000445464 348 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AADACP1-203ENST00000471766 707 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC073167.1-201ENST00000559303 580 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CACNB1Q02641 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNB1Q02641 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms