Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
XPCQ01831 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XPCQ01831 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XPCQ01831 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XPCQ01831 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XPCQ01831 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XPCQ01831 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
XPCQ01831 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XPCQ01831 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XPCQ01831 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms