Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN7AQ01118 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN7AQ01118 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms