Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
EFNB1P98172 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNB1P98172 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms