Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms