Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
UFM1P61960 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
UFM1P61960 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms