Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ARF3P61204 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ARF3P61204 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF3P61204 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF3P61204 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF3P61204 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF3P61204 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF3P61204 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF3P61204 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF3P61204 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ARF3P61204 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms