Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CRISP1P54107 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRISP1P54107 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms