Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms