Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGDP52209 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PGDP52209 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PGDP52209 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PGDP52209 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PGDP52209 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms