Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RORCP51449 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RORCP51449 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RORCP51449 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RORCP51449 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RORCP51449 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RORCP51449 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RORCP51449 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RORCP51449 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RORCP51449 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RORCP51449 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RORCP51449 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RORCP51449 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms