Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CSNK1A1P48729 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms