Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ATRXP46100 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ATRXP46100 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ATRXP46100 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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