Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FDFT1P37268 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms