Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms