Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4AP27815 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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