Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NFKBIAP25963 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NFKBIAP25963 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms