Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LMO1P25800 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LMO1P25800 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LMO1P25800 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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