Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CD247P20963 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CD247P20963 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CD247P20963 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms