Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPRAP18433 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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