Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ85

DUX4L2, Double homeobox protein 4-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L2P0CJ85 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DUX4L2P0CJ85 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms