Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
POP4O95707 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
POP4O95707 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POP4O95707 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
POP4O95707 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
POP4O95707 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
POP4O95707 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
POP4O95707 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms