Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCNKO75909 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCNKO75909 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCNKO75909 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCNKO75909 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms