Protein–RNA interactions for Protein: O60671

RAD1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD1O60671 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD1O60671 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAD1O60671 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms