Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BCKDKO14874 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms