Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
H3BNH8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
H3BNH8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H3BNH8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H3BNH8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms