Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WASHC1A8K0Z3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms