Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SOBPA7XYQ1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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