Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AUP1Q9Y679 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms