Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TTF2Q9UNY4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TTF2Q9UNY4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms