Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CGGBP1Q9UFW8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CGGBP1Q9UFW8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms