Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DKK2Q9UBU2 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms