Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HCN3Q9P1Z3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HCN3Q9P1Z3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms