Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4Q9P0V3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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