Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
VAPAQ9P0L0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms