Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NKIRAS1Q9NYS0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms