Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NKIRAS2Q9NYR9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms