Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms