Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FANCFQ9NPI8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms