Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
RAB18Q9NP72 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RAB18Q9NP72 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms