Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USP29Q9HBJ7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms